GBIF a intégré un nouvel Explorateur de Phylogénétique sur le portail des Légumineuses, un projet du Groupe de Travail sur la Phylogénie des Légumineuses. Publié pour soutenir les présentations d’ouverture du 8ème Congrès International sur les Légumineuses (8ILC) à Piernópolis, Brésil, le 6 août 2023, cet outil de visualisation propose une nouvelle vision des données d’occurrences d’espèces du réseau GBIF, les organisant en accord avec les preuves phylogénétiques actuelles à propos des relations évolutives entre les espèces de cette vaste et cosmopolite famille que sont les Légumineuses.
La vue par défaut de cet outil expérimental présente les données d’occurrences mises à disposition par GBIF en concordance avec la phylogénie récemment publiée des espèces de Caesalpinioideae (Ringelberg et al. 2023). Les utilisateurs peuvent naviguer et sélectionner des enregistrements pour 1860 espèces aux extrémités des branches de l’arbre ainsi qu’au niveau de certains taxa supérieurs à la jonction des branches. Tous les taxa sont mis en corrélation avec le squelette taxonomique de GBIF. Les cartes présentées pour n’importe quelle espèce individuelle dans la phylogénie correspondent donc aux cartes d’espèces disponibles sur GBIF.org.
L’innovation de cet outil est sa capacité à cartographier des occurrences pour un clade au complet, ou un groupe de taxa liés par un ancêtre commun, à l’aide d’un seul clic. Les utilisateurs peuvent également sélectionner et comparer plusieurs clades, incluant des clades frères, naviguer dans l’arbre phylogénétique, modifier la visualisation et les couleurs de la carte et télécharger les occurrences sélectionnées. Cet effort de recherche et développement en cours se base sur les apprises de ses projets prédécesseurs, PhyloJive et PhyloLink.
“The Phylogenetic Explorer presents a large, ecologically important and globally distributed family that can serve as a test case for systematists around the world,” a expliqué Anne Bruneau de l’Université de Montreal. “Our working group has worked as a community since 2010 to facilitate and disseminate research on legume systematics, taxonomy, and biodiversity, so we’re thrilled with these advances.”
Le Portail des Légumineuses, soutenu par Canadensys et GBIF, fonctionne en tant qu’instance du service de portail hébergé de GBIF. Les membres du groupe de travail ont utilisé des versions antérieures de l’explorateur afin de soutenir la curation communautaire, ce qui a abouti à la publication de la première version de la liste globale des Légumineuses approuvée par la communauté, améliorant la précision des données d’occurrences, de biodiversité et de taxonomie. Des développements et partenariats futurs sont planifiés suite à ce lancement public initial. Les commentaires des utilisateurs sont donc les bienvenus et peuvent être envoyés à phylogeny@gbif.org.
“I’m confident that enabling this shift in perspective to a DNA-based classification will open new avenues for research,” a expliqué Joe Miller, GBIF executive secretary. “But equally exciting is the promise that this technical research and development effort holds for directly supporting the policy-relevant indicators of phylogenetic diversity.”