Legume Taxonomy Working Group

Information about the Legume Taxonomy Working group

Coordonatrices : Anne Bruneau (Université de Montréal, Canada) et Marianne le Roux (South African National Biodiversity Institute, SANBI, South Africa).

Introduction

Le groupe de travail sur la taxonomie des légumineuses a pour objectif principal de dresser une liste consensuelle de noms d’espèces de légumineuses et de leurs synonymes, approuvée par la communauté. Étant donné que plusieurs resources en ligne sont désormais obsolètes, la communauté des légumineuses a considéré cette initiative comme essentielle pour étayer les recherches en cours et futures sur la famille. Notre objectif est de fournir une classification des familles précise et à jour qui peut être utilisée pour des analyses en aval de toutes sortes de questions en recherche appliquée et fondamentale, y compris à des fins de conservation, d’agronomie et d’infrastructure verte. Cette liste d’espèces à jour constituera également l’épine dorsale essentielle pour d’autres groupes de travail du LPWG se concentrant sur l’assemblage de données d’occurrence et de traits fonctionnels à partir, par exemple, de bases de données publiques, de littérature et de collections. Enfin, nous nous attendons à ce que la liste d’espèces vérifiée et approuvée par le LPWG soit adoptée et utilisée comme épine dorsale taxonomique pour les légumineuses dans de grandes initiatives internationales telles que le Global Biodiversity Information Facility (GBIF), le Catalogue of Life, World Flora Online et plusieurs projets phylogénomiques en cours. Ceci est important pour éviter la duplication des efforts d’un petit groupe d’experts en taxonomie.

Stratégie

En collaboration avec Rafaël Govaerts des Royal Botanic Gardens de Kew, le groupe de travail sur la taxonomie a lancé le processus en utilisant les données de la liste d’espèces de base de Kew, disponibles en téléchargement sur la [World Checklist of Vascular Plants (WCVP)] de Kew (https://wcvp.science.kew.org/). Cette liste d’espèces’ de base renvoie à l’International Plant Name Index (IPNI) et sous-tend également le site Internet Plants of the World Online. La liste WCVP comprend tous les champs Darwin Core que la communauté des légumineuses considère comme importants pour les analyses en aval. Pour réviser la liste des noms d’espèces de légumineuses, un réseau de 38 coordinateurs de sous-familles (et tribus pour les Papilionoideae) s’est vu confier la tâche d’approcher et de coordonner les experts en taxonomie des légumineuses intéressés afin de les aider à vérifier et à éditer la liste de noms de légumineuses. Les listes révisées sont transmises à Rafaël Govaerts qui vérifie les modifications proposées et intègre les informations dans une liste actualisée d’espèces de légumineuses. Le groupe de travail sur la taxonomie a également créé un comité dont le rôle est d’évaluer et de prendre une décision sur les taxonomies conflictuelles (souvent, la reconnaissance ou non de certains genres), et qui s’est réuni pour la première fois en décembre 2020. La liste révisée des espèces reconnaît l’apport des contributeurs à la ratification de la taxonomie des légumineuses. La liste la plus récente des noms acceptés est visible sur Checklist Bank, sur le Legume Data Portal, et sur Zenodo.

Plans futurs

À terme, la liste taxonomique pourra être utilisée pour créer des liens et synthétiser d’autres types de données : traits, descriptions, taxonomie de niveau supérieur, données d’occurrence et de spécimens, cartes et images dynamiques. L’un des objectifs du LPWG est de rassembler des informations sur les légumineuses afin qu’elles soient facilement accessibles et utiles aux chercheurs et autres utilisateurs du monde entier. Dans une publication de 2019, la communauté des légumineuses a exprimé le besoin d’un portail en ligne pour la famille qui engloberait des ensembles de données plus riches provenant de plusieurs partenaires utilisant une liste d’espèces solide et bénéficiant des connaissances détenues par le LPWG.

Rejoignez le Groupe de Travail

Si vous souhaitez participer à cette démarche et partager votre expertise taxonomique, veuillez contacter Anne Bruneau ou Marianne le Roux.

La liste des genres qui doivent encore être vérifiés est disponible ici. N’hésitez pas à nous contacter si vous pouvez contribuer !

Lectures complémentaires : Bruneau, A., Borges, L.M., Allkin, R., Egan, A.N., De la Estrella, M., Javadi, F., Klitgaard, B., Miller, J.T., Murphy, D.J., Sinou, C., Vatanparast, M. & Zhang, R. 2019. Towards a new online species-information system for legumes. Australian Systematic Botany 32: 495–518. Link

Le Roux, M.M. Miller, J.T., Waller, J., Döring, M. & Bruneau, A. 2022. An expert curated global legume checklist improves the accuracy of occurrence, biodiversity and taxonomic data. Scientific Data 9:708. Link